Il messaggio di avviso che hai fornito, "CageFS jail error Failed to set permissions to... (Operation not permitted): Operation not permitted (1)", indica che CageFS sta incontrando un problema di autorizzazioni durante il tentativo di impostare le autorizzazioni all'interno dell'ambiente del jail di CageFS.
Ecco i passaggi che puoi seguire per risolvere questo problema:
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Verifica le autorizzazioni dell'utente: Assicurati che l'utente che esegue i comandi di CageFS abbia le autorizzazioni necessarie per modificare i file e le directory all'interno del jail di CageFS. 
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Esegui i comandi di CageFS come root o con sudo: Prova a eseguire i comandi di CageFS con privilegi elevati utilizzando sudo. Ad esempio: sudo cagefsctl --force-update
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Verifica le politiche SELinux o AppArmor: Se stai utilizzando SELinux o AppArmor, potrebbero essere in atto politiche di sicurezza che impediscono alcune operazioni. Controlla le politiche per assicurarti che non stiano causando il problema. 
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Verifica la configurazione di CageFS: Controlla di nuovo i file di configurazione di CageFS (ad esempio, /etc/cagefs/conf/cagefs.conf) per assicurarti che siano configurati correttamente. 
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Reinizializza CageFS: Prova a reinizializzare CageFS per applicare eventuali modifiche apportate alla configurazione. Puoi farlo con il seguente comando: cagefsctl --force-update
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Verifica problemi con il disco o il filesystem: Esegui controlli sul filesystem (fsck) sulle partizioni in cui CageFS sta cercando di impostare le autorizzazioni per assicurarti che siano in buone condizioni. 
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Controlla i log di sistema: Controlla i log di sistema (/var/log/messages, /var/log/syslog, ecc.) per cercare eventuali messaggi di errore pertinenti o indizi sulla causa del problema. 
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Contatta il fornitore di hosting o il supporto: Se non sei l'amministratore del server o se CageFS è stato fornito da un fornitore di hosting, contattali per assistenza. Potrebbero avere passaggi o configurazioni specifiche da seguire. 
Ricorda che apportare modifiche alle configurazioni del filesystem può avere gravi conseguenze, quindi è importante procedere con cautela e considerare di chiedere assistenza a un amministratore di sistema o al supporto se non sei sicuro di alcuni passaggi.
 
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