Сообщение об ошибке, которое вы видите, "[Errno 13] Permission denied", указывает на то, что у пользователя или процесса, пытающегося сохранить данные в указанной директории (/var/cagefs/.../cl.php.d/), нет необходимых прав для этого.

Вот шаги, которые вы можете предпринять для решения этой проблемы:

Проверьте права доступа:

Убедитесь, что у пользователя, пытающегося сохранить файл, есть соответствующие права для записи в указанную директорию. Вы можете использовать команду ls -l для просмотра прав доступа к директории и её родительским директориям.

Владельцы и группа:

Проверьте, что владельцы пользователя и группы установлены правильно. Возможно, вам нужно будет использовать команды chown и chgrp для изменения владельцев, если это необходимо:

sudo chown -R username:groupname /var/cagefs/.../cl.php.d/

Проверьте SELinux или AppArmor (если применимо):

Если ваша система использует SELinux или AppArmor, эти модули безопасности могут препятствовать записи файлов. Возможно, вам нужно будет настроить контекст безопасности или политику, чтобы разрешить запись в эту директорию.

Проверьте квоты на файловой системе:

Проверьте, есть ли на файловой системе квоты, которые могут ограничивать количество данных, которые можно записать в эту директорию.

Конфигурация CageFS:

CageFS — это виртуализованная файловая система. Убедитесь, что CageFS правильно настроен и что пользователь, пытающийся записать в эту директорию, включён в окружение CageFS.

Временное решение:

Если вам срочно нужно записать в эту директорию, вы можете попробовать использовать sudo (если у вас есть необходимые привилегии) или обратиться к системному администратору для выполнения этой операции.

Обратитесь к системному администратору или провайдеру хостинга:

Если вы не можете решить проблему самостоятельно, обратитесь к системному администратору или провайдеру хостинга за помощью. У них могут быть определённые политики или конфигурации, которые необходимо учитывать.

Не забудьте заменить "username" и "groupname" в команде chown на фактического пользователя и группу, которые должны владеть этой директорией. Также всегда будьте осторожны при изменении прав доступа или владельцев системных директорий, так как некорректные изменения могут вызвать другие проблемы. Если сомневаетесь, проконсультируйтесь с системным администратором или провайдером хостинга.